Affaldsøerne kan have negative følger for havplankton som står for hovedparten af jordens iltforsyning, og effekten af såkaldt biomagnifikation er ukendt. Biomagnifikation er når en lille fisk spiser fx 10 stykker plastik, en større fisk spiser 10 af de små fisk og har dermed 100 stykker plastik i sig, den store fisk ædes af en endnu større fisk etc.